Détecter tôt – les mauvaises herbes aux premiers stades de croissance

La valeur agronomique d’une détection décroît avec le temps. Une adventice traitée au stade cotylédonaire concurrence peu la culture ; la même plante traitée trois semaines plus tard a déjà consommé de l’eau, des nutriments et de la lumière.Or c’est exactement au stade le plus précoce que la reconnaissance est la plus difficile. Cet article expose cette tension, ses conséquences pratiques et ce qu’un corpus doit contenir pour la traiter. Il prolonge l’article consacré au désherbage mécanique robotisé.

Pourquoi le stade précoce compte

Quatre raisons agronomiques justifient d’intervenir tôt.Elles se cumulent.La concurrence commence dès la levée, une adventice installée avant la culture prenant un avantage que la suite ne rattrape pas.La période critique de nuisibilité, pendant laquelle la présence d’adventices détermine la perte de rendement, se situe dans les premières semaines du cycle.Les moyens de destruction sont plus efficaces sur des plantes jeunes, une plantule s’arrachant ou se détruisant avec une énergie sans rapport avec celle qu’exige une plante développée.Et l’intervention tardive laisse monter à graines une part des adventices, ce qui alimente le stock semencier et reporte le problème sur les campagnes suivantes.Une conséquence pratique importante en découle pour tout projet de détection de mauvaises herbes. Ces quatre raisons font converger l’optimum agronomique vers un stade où la détection de mauvaises herbes atteint sa difficulté maximale, tension qui structure tout ce qui suit.

Pourquoi la reconnaissance échoue au stade précoce

Cinq propriétés rendent une plantule difficile à identifier en détection de mauvaises herbes.Les caractères distinctifs ne sont pas encore formés, la morphologie foliaire d’une espèce se manifestant après le stade cotylédonaire.Les cotylédons se ressemblent entre espèces voisines, ce qui rend la distinction impossible pour une part de la flore.La taille est faible au regard de la résolution disponible, une plantule n’occupant que quelques pixels dans une image de drone.Le contraste avec le sol est réduit lorsque la plantule est petite et le sol humide.Et la variabilité individuelle est maximale, deux plantules de même espèce et de même âge pouvant différer selon la profondeur de semis et la structure du sol.Une observation importante en découle. Ces cinq propriétés se cumulent et aucune n’est corrigible par un modèle plus performant, ce qui déplace la réponse vers la résolution d’acquisition et vers la formulation de la tâche plutôt que vers l’architecture.

La courbe de valeur et la courbe de difficulté

Un raisonnement simple éclaire le choix du stade.Il mérite d’être posé explicitement dans tout projet de détection de mauvaises herbes.La valeur d’une intervention décroît avec le stade et la fiabilité de la détection croît avec lui.Trois lectures s’en dégagent.L’optimum n’est ni au plus tôt ni au plus tard, il se situe au point où le produit des deux est maximal.Ce point dépend du couple culture et flore, une culture à période critique longue tolérant une intervention plus tardive.Et il dépend du moyen de destruction, un outil efficace sur plantes développées relâchant la contrainte de précocité.Une conséquence pratique en découle pour un projet de détection de mauvaises herbes. Ce point ne se détermine pas en salle : il se mesure en évaluant la performance de détection par stade sur un corpus couvrant la fenêtre entière, ce qui suppose d’annoter au delà du stade visé pour pouvoir arbitrer.

Ce que la résolution impose

Cette contrainte physique borne la détection précoce.Elle est régulièrement sous-estimée.Une plantule doit occuper un nombre suffisant de pixels pour être détectée, et davantage encore pour être identifiée.Trois conséquences en découlent.Le drone à altitude standard ne convient pas au stade précoce, sa résolution au sol plaçant une plantule sous le seuil de détection.La caméra embarquée à faible hauteur devient la modalité de référence, sa proximité fournissant la résolution nécessaire.Et la vitesse d’avancement se trouve doublement contrainte, la résolution demandant une exposition courte et la faible taille des objets exigeant un traitement soigné.Une observation en découle. Cette contrainte explique que les systèmes de détection précoce soient majoritairement embarqués sur outil plutôt qu’aéroportés, orientation qui détermine le type de corpus à constituer et qui doit être arrêtée avant toute acquisition.

Reformuler la tâche pour le stade précoce

Trois reformulations rendent la détection de mauvaises herbes traitable là où la reconnaissance échoue.Le passage au binaire, la distinction culture contre non-culture restant possible quand la distinction entre espèces d’adventices ne l’est plus.Le recours à la géométrie, la position par rapport au rang suppléant la morphologie comme les articles précédents l’ont exposé.Et le raisonnement par densité, l’écart au compte attendu signalant une infestation sans identification individuelle.Une observation importante traverse ces trois reformulations. Toutes renoncent à l’identification d’espèce et conservent l’information dont le traitement a besoin, ce qui les rend compatibles avec la plupart des usages de désherbage et incompatibles avec le traitement sélectif par espèce.

Ce que le corpus doit contenir

Cinq exigences caractérisent un corpus destiné au stade précoce.La couverture des stades doit être fine, un intervalle de quelques jours entre deux stades produisant des apparences distinctes qu’un corpus grossier ne représente pas.Les conditions de sol doivent varier, l’humidité et la texture modifiant fortement le contraste avec la plantule.Les résidus de culture doivent figurer, ils occupent le sol au stade précoce et constituent la principale source de fausses détections.La classe des objets indéterminés doit être largement utilisée, une part significative des plantules étant réellement indécidable.Et le stade doit être consigné comme métadonnée plutôt que déduit de l’apparence, ce qui permet d’évaluer la performance par stade.Une conséquence pratique en découle pour un projet de détection de mauvaises herbes. La dernière exigence coûte un champ à renseigner lors de l’acquisition et elle conditionne l’arbitrage exposé plus haut, ce qui la rend disproportionnellement rentable.

Le problème des résidus

Cette configuration domine les fausses détections au stade précoce.Elle mérite un traitement séparé.Les résidus de la culture précédente couvrent le sol au moment où les plantules émergent.Quatre difficultés en découlent.Les fragments verts de résidus se confondent avec des plantules, notamment après une pluie qui les réhydrate.Les résidus masquent partiellement les plantules, ce qui produit des objets tronqués difficiles à qualifier.Leur répartition est irrégulière, ce qui rend la difficulté variable d’une zone à l’autre de la même parcelle.Et leur quantité dépend de la pratique culturale, une parcelle en semis direct présentant une couverture bien supérieure à une parcelle labourée.Une observation importante en découle. Ces quatre difficultés font des systèmes de conservation des sols le contexte le plus exigeant pour la détection précoce, ce qui est doublement problématique puisque ces pratiques progressent et qu’elles limitent par ailleurs le recours au désherbage mécanique.

Nommer le stade correctement

Une question de vocabulaire conditionne la cohérence d’un corpus et elle est souvent tranchée par défaut.Le stade d’une plante peut se désigner de plusieurs manières et elles ne sont pas équivalentes.Quatre conventions coexistent en pratique.Le nombre de jours après semis ou après levée, commode à enregistrer et peu fiable, la vitesse de développement dépendant fortement de la température et de l’humidité.L’échelle phénologique standardisée, précise et exigeant une compétence pour être appliquée correctement.Le nombre de feuilles vraies, repère simple et observable directement sur l’image, largement suffisant pour la plupart des projets.Et la taille en centimètres, mesurable et peu informative sur le développement réel puisque deux espèces de même taille peuvent être à des stades très différents.Une conséquence pratique en découle pour un projet de détection de mauvaises herbes. La troisième convention offre le meilleur compromis, elle s’applique sans formation poussée, elle se vérifie sur l’image elle-même, et elle suffit à décomposer une évaluation par stade, ce qui est l’usage principal de cette métadonnée.

Évaluer une détection précoce

Quatre principes gouvernent cette évaluation.Ils diffèrent d’une évaluation ordinaire en détection de mauvaises herbes.La performance doit être décomposée par stade, une moyenne sur la fenêtre masquant l’effondrement à l’ouverture.Le taux d’objets indéterminés doit être rapporté, il mesure la part réellement indécidable et borne ce qu’un modèle peut atteindre.Les fausses détections sur résidus doivent être comptées séparément, elles constituent un mode d’échec distinct appelant une correction distincte.Et l’accord entre annotateurs doit être mesuré par stade, sa valeur au stade le plus précoce fournissant la borne de performance atteignable.Une conséquence pratique importante en découle. Le dernier principe produit fréquemment un chiffre inconfortable, et c’est précisément sa valeur : il permet de refuser une exigence contractuelle irréaliste par un fait mesuré plutôt que par une appréciation.

Ce que la détection précoce ne permet pas

Quatre limites méritent d’être posées.Cet objectif est souvent affiché sans réserve.L’identification d’espèce reste hors de portée pour une part importante de la flore au stade cotylédonaire, y compris pour un expert.La fenêtre d’acquisition est très étroite, ce qui complique la constitution d’un corpus et impose parfois plusieurs saisons.Les adventices à levée échelonnée échappent partiellement, un passage précoce ne rencontrant pas celles qui lèveront ensuite.Et la détection sous couvert reste impossible, ce qui n’est pas limitant au stade précoce et le devient rapidement.Cette première limite est la plus conséquente. Elle signifie qu’un projet visant à la fois la précocité et l’identification d’espèce poursuit deux objectifs partiellement incompatibles, ce qui doit être établi au cadrage plutôt que constaté après l’annotation.

Aborder un projet de détection précoce

Cinq questions cadrent ce type de projet et elles se posent en une réunion.Quel stade est visé, exprimé en repères observables plutôt qu’en jours après semis.L’identification d’espèce est-elle requise à ce stade. Une réponse positive impose de vérifier sa faisabilité avant tout engagement.Quelle résolution l’acquisition fournit-elle au sol. Cette réponse détermine si le stade visé est détectable.Quelle est la couverture en résidus des parcelles concernées. Cette réponse dimensionne la difficulté principale.Et le stade sera-t-il consigné à l’acquisition. Cette réponse conditionne toute évaluation par stade.Ces cinq réponses déterminent la faisabilité, la modalité et le corpus. Les poser avant d’acquérir évite le cas le plus fréquent de ce domaine, un corpus constitué à un stade où l’objectif affiché n’était pas atteignable.

Ce que ce chapitre enseigne

Une observation transversale mérite de clore cet examen car elle vaut au delà de ce domaine.La détection précoce illustre une configuration où la valeur et la faisabilité varient en sens inverse.Trois constats la composent.L’optimum ne se situe à aucune des deux extrémités et il ne se devine pas, il se mesure.Cette mesure suppose un corpus plus large que l’objectif, puisqu’il faut couvrir les stades que l’on écartera pour pouvoir justifier de les écarter.Et la mesure du désaccord entre annotateurs au stade le plus difficile fournit la seule borne opposable à une exigence irréaliste.Ce constat rejoint exactement celui que les séries consacrées à la segmentation d’images satellites et au LiDAR aérien ont établi : la borne de performance n’est pas une propriété du modèle mais de la capacité d’un observateur à trancher sur la donnée disponible, et la connaître avant de s’engager protège les deux parties.

Les erreurs les plus fréquentes

  • Viser l’identification d’espèce au stade cotylédonaire.
  • Employer un drone à altitude standard pour une détection précoce.
  • Exprimer le stade visé en jours après semis plutôt qu’en repères observables.
  • Constituer un corpus sans consigner le stade à l’acquisition.
  • Écarter du corpus les parcelles couvertes de résidus.
  • Ne pas décomposer la performance par stade lors de l’évaluation.
  • Négliger la classe des objets indéterminés au stade le plus précoce.
  • Restreindre le corpus au stade visé sans couvrir les stades voisins.
  • Supposer que la fenêtre d’acquisition permet de compléter un corpus en une saison.
  • Accepter une exigence de performance sans avoir mesuré l’accord entre annotateurs au stade concerné.

Les levées échelonnées

Une caractéristique de la flore adventice complique le raisonnement par stade et elle mérite d’être exposée.Les adventices ne lèvent pas toutes en même temps, une même parcelle présentant simultanément des plantules et des plantes développées.Trois conséquences en découlent.Une image contient plusieurs stades à la fois, ce qui interdit d’attribuer un stade à l’image et impose de le porter au niveau de l’objet lorsque cette information est requise.Un passage unique ne traite qu’une partie de la population, celles qui lèveront après restant intactes.Et la difficulté de détection varie au sein d’une même image, les plantules récentes étant beaucoup plus délicates que les plantes établies qui les entourent.Une observation importante en découle ici. Cette hétérogénéité plaide pour une stratégie de passages répétés plutôt que pour un passage unique optimalement placé, ce qui rejoint la logique du désherbage mécanique et s’accorde mal avec celle d’un traitement chimique unique.

Ce que l’annotation demande au stade précoce

Cinq exigences distinguent ce travail de l’annotation à un stade développé.Le zoom devient l’outil principal, une plantule occupant trop peu de pixels pour être qualifiée à l’échelle d’affichage courante.La cadence chute nettement, chaque objet demandant un examen là qu’une plante développée se reconnaît d’un coup d’œil.La fatigue visuelle s’installe plus vite, ce qui recommande des sessions plus courtes et un contrôle renforcé en fin de session.Le recours à la classe indéterminée doit être encouragé plutôt que toléré, faute de quoi les annotateurs tranchent au hasard sur une part significative des objets.Et la double annotation devient plus utile qu’ailleurs, le désaccord étant à la fois plus fréquent et plus informatif à ce stade.Une conséquence pratique en découle pour un projet de détection de mauvaises herbes. Ces cinq exigences se traduisent en un coût par objet nettement supérieur à celui d’un corpus à stade développé, écart qui doit figurer dans un chiffrage plutôt que se découvrir en production.

Le rôle de la vérité terrain destructive

Une méthode permet de lever une part de l’indécidabilité et elle est peu employée.Une plantule indéterminée sur l’image peut être identifiée en la laissant se développer ou en la prélevant.Trois protocoles distincts en découlent.Le suivi photographique d’une même plantule à plusieurs dates, qui permet d’attribuer rétrospectivement l’espèce aux images précoces une fois la plante identifiable.Le prélèvement avec repérage précis, qui permet une détermination en laboratoire et fournit une vérité terrain incontestable.Et le marquage physique de plantules suivies, qui garantit de retrouver le même individu entre deux passages.Une observation importante en découle. Le premier protocole est le plus économique et il produit exactement ce qui manque à ce domaine, un corpus de plantules dont l’espèce est connue par un moyen extérieur à l’image, ce qui permet à la fois d’entraîner et de mesurer ce qu’un observateur humain pouvait légitimement en dire.Une conséquence pratique s’ensuit pour un projet de détection de mauvaises herbes. Ce protocole demande une organisation de terrain sur une saison, il ne s’improvise pas, et un corpus ainsi constitué a une valeur nettement supérieure à un corpus annoté par jugement sur image seule.

Les seuils de nuisibilité

Une notion agronomique nuance l’exigence de précocité et elle est rarement mobilisée dans les discussions techniques.Toutes les adventices ne justifient pas une intervention, un seuil de densité en dessous duquel la perte de rendement reste inférieure au coût du traitement.Trois conséquences en découlent pour un projet de détection de mauvaises herbes.La détection exhaustive n’est pas toujours l’objectif, une estimation de densité pouvant suffire à déclencher ou non une intervention.Le seuil dépend de l’espèce, une adventice très concurrentielle justifiant une intervention à densité bien inférieure.Et il dépend du coût du traitement, un désherbage mécanique bon marché abaissant le seuil au delà duquel il devient rentable.Une observation intéressante en découle. Cette notion transforme parfois un problème de détection individuelle en problème d’estimation de densité, formulation nettement plus accessible au stade précoce et qui devrait être examinée avant de conclure à l’infaisabilité.

Deux passages plutôt qu’un

Une stratégie répond à la tension centrale de ce chapitre et elle mérite d’être proposée explicitement.Plutôt que de chercher le stade optimal unique, deux interventions à des stades différents traitent séparément ce que chacune sait faire.Trois arguments la soutiennent solidement.Le premier passage, très précoce, traite en binaire sans identification, formulation faisable à ce stade et suffisante pour l’essentiel de la population levée.Le second passage, plus tardif, traite les levées ultérieures et les échecs du premier, avec une identification devenue possible.Et chaque passage travaille dans son domaine de faisabilité, ce qui évite de dimensionner un système unique sur le cas le plus difficile.Une conséquence pratique en découle pour un projet de détection de mauvaises herbes. Cette stratégie demande deux corpus plutôt qu’un et elle produit deux systèmes plus simples que le système unique qu’elle remplace, arbitrage dont le solde est souvent favorable et qui est rarement examiné.

La question à poser en premier

Une seule question tranche la faisabilité d’un projet de détection précoce, et elle se pose avant toute discussion technique.Que fera le système de l’information, à ce stade précis.Si la réponse est traiter uniformément, la distinction binaire suffit et le projet est faisable.Si la réponse est choisir un produit selon l’espèce, la faisabilité doit être vérifiée sur échantillon avant tout engagement.Et si la réponse est décider d’intervenir ou non à l’échelle d’une zone, une estimation de densité suffit et le projet devient nettement plus simple.Cette question précède toutes les autres. Elle détermine si la difficulté du stade précoce est un obstacle ou une simple contrainte de résolution.

Ce qu’il faut retenir

La valeur agronomique d’une intervention décroît avec le stade et la fiabilité de la détection croît avec lui, tension qui structure ce domaine.Trois lectures se dégagent. L’optimum ne se situe à aucune extrémité et il se mesure plutôt qu’il ne se devine, ce qui suppose d’annoter au delà du stade visé afin de pouvoir arbitrer sur des chiffres. La résolution nécessaire au stade précoce écarte le drone à altitude standard et impose l’acquisition embarquée, orientation qui détermine le type de corpus et doit être arrêtée avant toute acquisition. Et l’identification d’espèce reste hors de portée pour une part importante de la flore au stade cotylédonaire, y compris pour un expert, ce qui rend partiellement incompatibles la précocité et le traitement sélectif par espèce.Pour ce que ces contraintes impliquent au moment de constituer les images, l’article consacré au dataset de détection de mauvaises herbes détaille la méthode. Pour l’usage qui exige le plus cette précocité, l’article sur le désherbage mécanique robotisé expose les contraintes.Pour approfondir les modalités d’exécution, les formats pris en charge et les dispositifs de contrôle applicables, vous pouvez consulter notre page dédiée au traitement de données agricoles. Et si vous devez constituer un corpus au stade précoce, échangeons sur votre projet.
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