
Annotation d'images et traitement
de données médicales
Des données médicales fiables et précises pour entraîner vos modèles d’IA, de l’imagerie et la vidéo chirurgicale aux données cliniques, avec l’expertise de médecins spécialistes.

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Ce que nous faisons
Plus de 50 médecins spécialistes au service de vos projets d'IA médicale
Radiologues, cardiologues, généralistes, pédiatres et autres spécialistes peuvent intervenir directement dans l’annotation ou le contrôle de vos données médicales.
Cette expertise clinique, associée à nos processus qualité, permet de produire des datasets fiables et précis pour entraîner et évaluer vos modèles d’IA en santé.
Processus rigoureux et contrôlé
Chaque projet débute par un pilote permettant d’analyser vos données, vos consignes et le niveau d’expertise médicale nécessaire. Les cas complexes sont identifiés en amont afin de définir précisément le processus d’annotation et de contrôle.
Selon les besoins, les annotations sont réalisées par des opérateurs formés, des médecins spécialistes ou une combinaison des deux, afin d’adapter le niveau d’expertise à chaque tâche.
La qualité est mesurée tout au long de la production, avec un niveau contractuel de 95 %, 97 % ou 99 % et des contrôles adaptés au niveau choisi.
Sécurité et conformité ISO 27001
Infoscribe est certifiée ISO 27001 : 2022 et intègre la protection des données à chaque étape du projet. Accès contrôlés, transferts chiffrés et traçabilité des opérations permettent de préserver la confidentialité et l’intégrité de vos données médicales.
Lorsque le projet l’exige, nous pouvons recourir à un hébergement HDS en France. Pour les données les plus sensibles, nos équipes peuvent également travailler directement sur votre infrastructure afin que celles-ci ne quittent jamais vos serveurs.
La sécurité s’adapte ainsi à vos contraintes réglementaires, techniques et de confidentialité, sans compromettre la capacité de production.
Technologies et outils
Nous adaptons les outils au type de données médicales et au workflow de chaque projet. Nos équipes peuvent travailler sur des images et volumes aux formats DICOM ou NIfTI, notamment avec 3D Slicer pour les projets d’imagerie médicale 3D.
Nous pouvons également intervenir directement sur vos propres plateformes et outils d’annotation afin de nous intégrer à votre environnement existant et de limiter les transferts de données.
L’environnement technique est défini dès le pilote en fonction des modalités à traiter, des annotations attendues et de vos exigences de sécurité.
EXpertises
Le traitement de données médicales est une étape stratégique et scientifique essentielle pour l’intelligence artificielle en santé.
Chez Infoscribe, nous combinons expertise médicale, processus qualité et sécurité des données pour produire des datasets fiables et exploitables. Selon la complexité clinique, les annotations peuvent être réalisées ou contrôlées par des médecins spécialistes, avec un niveau de qualité contractuel de 95 %, 97 % ou 99 %.
Certifiée ISO 27001 : 2022 et capable de recourir à un hébergement HDS, Infoscribe accompagne vos projets d’IA médicale de l’imagerie 2D et 3D aux vidéos chirurgicales et données cliniques, dans un environnement adapté à la sensibilité de vos données.
Annotation d’Images Médicales pour IA
Segmentation de cellules sur images microscopiques
Segmentation précise des cellules pour les chercheurs en biologie cellulaire et en pathologie, générant des datasets fiables pour l’IA et la recherche.
Pathologies dermatologiques
Annotation, classification et segmentation d'images dermatologiques pour l'entraînement de modèles de Computer Vision : identification et délimitation de lésions cutanées, catégorisation selon les classes définies par le client et contrôle par des médecins lorsque le niveau d'expertise clinique l'exige.
Détection de fractures et d’objets étrangers sur scanners
Annotation et délimitation de fractures, corps étrangers et autres zones d'intérêt sur les examens d'imagerie médicale. Selon la complexité des cas, les annotations peuvent être réalisées ou contrôlées par des étudiants en 5e année de médecine, des médecins ou des radiologues, afin d'adapter le niveau d'expertise clinique aux exigences du projet.
Détection d’anomalies dentaires sur radiographies
Annotation et délimitation de structures dentaires et d'anomalies sur radiographies. Selon le projet, nous pouvons mobiliser des chirurgiens-dentistes pour l'annotation ou le contrôle.
Analyse d’IRM cérébrales
Segmentation 2D et 3D de structures anatomiques, lésions et régions d'intérêt sur IRM cérébrales, notamment à partir de volumes DICOM ou NIfTI.
Détection de nodules pulmonaires
Détection, localisation et segmentation de nodules pulmonaires sur scanners thoraciques, avec annotation 2D ou volumétrique 3D selon les besoins du modèle.
Segmentation de tissus et organes pour chirurgie assistée
Délimitation précise d'organes, tissus et structures anatomiques pour l'entraînement de systèmes de navigation, de planification et d'assistance chirurgicale.
Annotation d'échographies
Identification et segmentation de structures anatomiques sur images et séquences échographiques, y compris lorsque les contours sont peu contrastés ou variables d'une acquisition à l'autre. OphtalmologieDétection et segmentation de lésions et structures oculaires sur photographies du fond d'œil, OCT et autres examens d'imagerie ophtalmologique.Règle pour les cartes : conserver une longueur comparable à l'existant et éviter de répéter les mêmes arguments transversaux (médecins, ISO 27001, HDS, qualité). Chaque carte doit apporter des informations propres à la modalité ou au cas d'usage.
Analyse de rétinographies et images ophtalmologiques
Détection de rétinopathies, glaucome et autres anomalies oculaires pour les ophtalmologistes et modèles IA spécialisés.
Lésions gastro-intestinales sur endoscopies
Détection et segmentation de polypes, lésions et structures anatomiques sur images et vidéos endoscopiques, avec annotation frame par frame lorsque nécessaire.
Histopathologie
Annotation de lames histologiques numérisées : classification et segmentation de cellules, tissus, régions tumorales et autres zones d’intérêt sur des images haute résolution.
Cardiovasculaire
Segmentation de cavités cardiaques, vaisseaux et autres structures cardiovasculaires sur scanners, IRM et échographies pour l’entraînement de modèles d’IA.
Radiothérapie
Contourage et segmentation des volumes cibles, tumeurs et organes à risque sur scanners et IRM pour la planification et l’entraînement de modèles d’IA.
Suivi post-opératoire
Annotation comparative d’examens pré et post-opératoires pour suivre l’évolution anatomique, identifier des changements et quantifier les résultats d’une intervention.
Transcription Médicale pour l’IA
Transcription Audio Médicale
Services de transcription précis pour les enregistrements médicaux, consultations, conférences, séminaires et discussions cliniques, réalisés par des professionnels formés à la terminologie médicale
Transcription de Documents Médicaux
Conversion de documents écrits, numérisés ou manuscrits en formats électroniques structurés, conformes aux normes de l’industrie et aux réglementations (RGPD, HIPAA, etc.).
Transcription Multilingue
Transcription et normalisation de contenus médicaux dans différentes langues, pour des datasets exploitables à l’international et le développement de modèles IA multilingues
Résumé et Structuration de Notes Cliniques
Extraction des informations clés des notes de consultation, comptes rendus et correspondances, permettant une analyse rapide et un enrichissement des dossiers patients
Codage et Indexation pour IA
Intégration des données transcrites dans des formats standardisés (ICD, SNOMED, LOINC), facilitant l’exploitation par les systèmes de santé et applications d’IA.
Entraînement de Modèles de Reconnaissance Vocale Médicale
Utilisation de transcriptions annotées (locuteurs, spécialités, segments cliniques, types d’actes) pour entraîner et évaluer des modèles de speech-to-text adaptés au vocabulaire médical.
Sécurisation et Contrôle Qualité des Transcriptions
Relecture, validation et annotation des transcriptions par des experts médicaux afin de garantir un haut niveau de précision, détecter les ambiguïtés, corriger les erreurs critiques et constituer des jeux de données fiables pour l’entraînement et l’évaluation de modèles d’IA clinique.
Annotation de textes médicaux pour l’IA
Annotation d’Entités Nommées
Identification et marquage précis des entités dans les textes médicaux : noms de médicaments, pathologies, traitements, dosages, procédures et antécédents médicaux.
Extraction d’Informations Cliniques
Structuration des données issues des dossiers médicaux électroniques (DME) et documents patients, facilitant la gestion de l’information, le suivi clinique et la prise de décision médicale
Création de Comptes Rendus Médicaux Standards
Production de rapports clairs, concis et conformes aux exigences des établissements et professionnels de santé, livrés dans les délais impartis, garantissant fiabilité, qualité et efficacité pour vos projets IA
Codage et Normalisation de Données Médicales
Conversion des informations cliniques en standards internationaux (ICD, SNOMED, LOINC), pour une interopérabilité optimale et une utilisation facile par les systèmes de santé et applications IA
Analyse de Notes de Consultation et Correspondances
Annotation des notes cliniques, comptes rendus et courriers médicaux pour extraire informations clés et améliorer la qualité des datasets pour IA
Détection de Relations et Associations Médicales
Identification des relations entre maladies, traitements et effets secondaires pour créer des datasets structurés utilisés en recherche médicale et modélisation prédictive.
Analyse de Textes Multilingues
Annotation et normalisation de documents médicaux dans différentes langues, pour rendre les datasets exploitables à l’international.
Pharmacovigilance et événements indésirables
Annotation des mentions d’effets secondaires, interactions médicamenteuses et incidents thérapeutiques dans les textes cliniques, afin d’alimenter les systèmes d’alerte, de renforcer la sécurité patiente, soutenir les études de pharmacovigilance assistées par IA.
Témoignage et référence client

Autres Secteurs d'activité
FAQ
Questions fréquentes
Infoscribe prend en charge les principales modalités d’imagerie médicale utilisées pour l’entraînement, la validation et l’évaluation de modèles d’intelligence artificielle en santé. Nos équipes réalisent des prestations d’annotation d’images médicales en 2D et 3D sur des radiographies, scanners (CT), IRM, échographies, images endoscopiques, images dermatologiques, données ophtalmologiques et lames d’histopathologie numérisées.
Pour les radiographies, l’annotation médicale peut notamment concerner la détection et la délimitation de fractures, d’anomalies pulmonaires, de structures dentaires, de corps étrangers ou d’autres régions d’intérêt. Selon la complexité clinique du projet, l’annotation ou le contrôle peut être confié à des étudiants en médecine, des médecins, des radiologues ou des chirurgiens-dentistes.
Pour les scanners (CT) et les IRM, Infoscribe peut travailler sur des séries complètes et des volumes médicaux afin de réaliser des annotations 2D ou 3D : segmentation d’organes et de structures anatomiques, délimitation de lésions ou de tumeurs, détection et segmentation de nodules pulmonaires, contourage de volumes cibles ou d’organes à risque et autres régions d’intérêt définies par le client.
Les échographies peuvent être traitées sous forme d’images ou de séquences. L’annotation peut porter sur l’identification et la segmentation de structures anatomiques ou de zones d’intérêt, y compris lorsque les contours sont peu contrastés ou variables d’une acquisition à l’autre.
Infoscribe traite également des données d’endoscopie, notamment des images et vidéos gastro-intestinales pour la détection ou la segmentation de polypes, lésions et structures anatomiques. Les séquences peuvent être annotées frame par frame lorsque le projet d’IA médicale le nécessite.
En ophtalmologie, nous pouvons annoter des photographies du fond d’œil, des examens OCT et d’autres images ophtalmologiques. En dermatologie, les prestations peuvent inclure la classification, la détection ou la segmentation de lésions cutanées. En histopathologie, nos équipes peuvent travailler sur des lames numérisées haute résolution pour annoter des cellules, tissus, régions tumorales ou autres structures d’intérêt.
Selon les modalités, Infoscribe travaille notamment avec des données aux formats DICOM et NIfTI, ainsi qu’avec les formats d’images et de vidéos utilisés par le client. L’environnement et les outils d’annotation sont définis pendant le pilote en fonction de la modalité, du type d’annotation attendu et du niveau d’expertise médicale nécessaire.
Infoscribe prend en charge les principaux formats utilisés pour l’annotation de données médicales et l’entraînement de modèles d’intelligence artificielle en santé. Les formats acceptés et livrés sont définis avec le client en fonction de la modalité d’imagerie médicale, des outils d’annotation et du pipeline de machine learning ou de Computer Vision utilisé.
Le DICOM (Digital Imaging and Communications in Medicine) est l’un des principaux formats traités par Infoscribe. Utilisé notamment pour les radiographies, scanners (CT), IRM et certaines échographies, il permet de travailler directement sur des séries d’imagerie médicale et de conserver, lorsque le projet le nécessite, les informations techniques utiles au traitement des images.
Pour l’annotation et la segmentation de volumes médicaux en 3D, Infoscribe prend également en charge le format NIfTI (.nii et .nii.gz), couramment utilisé en neuro-imagerie, en IRM 3D et pour la segmentation volumétrique d’organes, de lésions ou d’autres structures anatomiques.
Les projets d’annotation d’images médicales en 2D peuvent également utiliser des formats comme PNG, JPEG ou TIFF, notamment pour la radiographie, la dermatologie, l’ophtalmologie, l’endoscopie ou certaines applications d’histopathologie. Nous pouvons également traiter des séquences vidéo lorsque le projet nécessite une annotation temporelle ou frame par frame.
Les annotations et segmentations peuvent être livrées sous différentes formes : masques de segmentation 2D ou 3D, coordonnées de bounding boxes, polygones, points d’intérêt, classifications, fichiers structurés ou autres représentations demandées par le client. Selon le workflow, les livrables peuvent notamment être produits en JSON, XML, COCO, masques PNG ou volumes NIfTI.
Infoscribe peut également travailler directement dans l’environnement d’annotation du client. Dans ce cas, les données médicales et leurs annotations peuvent rester dans les formats natifs de la plateforme, sans imposer une conversion ou un export intermédiaire.
Le format des données sources, le format des annotations et le format final de livraison sont validés pendant le pilote d’annotation médicale afin de vérifier leur compatibilité avec les outils du client et son pipeline d’entraînement ou d’évaluation de modèles d’IA.
Chez Infoscribe, le profil des annotateurs est défini en fonction de la complexité de la tâche, de la modalité d’imagerie médicale et du niveau d’expertise clinique nécessaire. Un projet d’annotation médicale peut ainsi mobiliser des annotateurs spécialisés, des étudiants en 5e année de médecine, des médecins généralistes ou spécialistes, des radiologues, des chirurgiens-dentistes ou d’autres professionnels de santé.
Pour les tâches d’annotation ne nécessitant pas d’interprétation clinique complexe, des annotateurs spécialisés en données médicales peuvent intervenir à partir de consignes précises et d’exemples validés. Cette organisation permet notamment de traiter des volumes importants de données tout en réservant l’intervention des professionnels de santé aux tâches qui nécessitent réellement leur expertise.
Lorsque l’annotation nécessite des connaissances médicales plus avancées, nous pouvons mobiliser des étudiants en 5e année de médecine ou des médecins pour réaliser directement les annotations, effectuer les contrôles ou traiter les cas ambigus.
Pour les projets d’imagerie médicale nécessitant une expertise spécialisée, Infoscribe peut faire intervenir des radiologues ou d’autres médecins spécialistes. C’est notamment le cas pour certaines annotations sur scanners (CT), IRM, radiographies ou échographies. Des chirurgiens-dentistes peuvent également intervenir sur les projets d’imagerie dentaire.
Au-delà des spécialités déjà mobilisées régulièrement, notre réseau de professionnels de santé nous permet de sourcer à la demande des médecins et spécialistes correspondant aux besoins spécifiques d’un projet. Nous pouvons ainsi constituer une équipe adaptée à la pathologie, à la modalité d’imagerie ou au domaine clinique concerné.
Le niveau d’expertise peut également différer entre la production et le contrôle. Un projet peut, par exemple, combiner une première annotation réalisée par une équipe formée avec une validation par un médecin spécialiste, ou prévoir une double annotation et un arbitrage des désaccords pour les cas les plus complexes.
Cette organisation est définie pendant le pilote d’annotation médicale afin d’adapter le niveau d’expertise au besoin réel du projet, plutôt que d’appliquer le même processus à toutes les données.
Infoscribe est certifiée ISO 27001:2022. Notre système de management de la sécurité de l’information encadre la protection des données tout au long du projet d’annotation médicale, depuis leur réception jusqu’à leur livraison et, lorsque le projet le prévoit, leur suppression.
Les accès aux données médicales et aux outils d’annotation sont limités aux personnes autorisées selon les besoins du projet. Les échanges de données peuvent être réalisés au moyen de transferts chiffrés, avec contrôle de l’intégrité des fichiers par checksum. Les accès et les environnements de travail sont définis en fonction du niveau de sensibilité des données.
Lorsque des données de santé doivent être hébergées dans un environnement répondant aux exigences françaises applicables à leur hébergement, Infoscribe peut mettre en place un hébergement HDS en France. Infoscribe ne se présente pas comme hébergeur certifié HDS : nous pouvons recourir à une infrastructure HDS lorsque le projet l’exige.
Lorsque les données doivent rester au sein de l’Union européenne, l’environnement de travail peut également être hébergé sur nos infrastructures situées en France. Pour les données médicales les plus sensibles, qui ne doivent pas quitter les serveurs du client, nous pouvons installer ou configurer les outils d’annotation directement sur son infrastructure et permettre à nos équipes d’y travailler à distance, sans transfert du dataset vers nos serveurs.
Une étape de dé-identification, anonymisation ou pseudonymisation des données médicales peut également être intégrée en amont de l’annotation afin de réduire l’exposition des données personnelles. Selon les données concernées, cette préparation peut notamment porter sur les métadonnées DICOM, les informations directement visibles dans les images ou documents, ou d’autres éléments identifiants.
L’architecture de sécurité, les modalités de transfert, les droits d’accès, la localisation des données et les règles de conservation sont définis avec le client en fonction de son projet, de ses exigences contractuelles et du cadre réglementaire applicable.
Oui. Infoscribe peut intégrer une étape de dé-identification des données médicales avant leur mise à disposition des équipes d’annotation. L’objectif est de supprimer ou masquer les informations permettant d’identifier directement ou indirectement un patient tout en préservant les données nécessaires au projet d’intelligence artificielle.
Pour les données d’imagerie médicale au format DICOM, la dé-identification peut notamment porter sur les métadonnées contenant des informations relatives au patient, à l’établissement ou à l’examen. Lorsque des informations identifiantes sont directement intégrées dans les pixels de l’image, elles peuvent également être détectées et masquées avant l’annotation.
Infoscribe peut aussi intervenir sur des documents et données cliniques textuelles afin de supprimer, masquer ou remplacer les informations identifiantes selon les règles définies avec le client. Pour les vidéos médicales ou chirurgicales, le traitement peut inclure le masquage ou le floutage d’éléments identifiants lorsque cela est nécessaire.
Selon les objectifs du projet, le processus peut relever de la dé-identification, de la pseudonymisation ou de l’anonymisation. Les règles à appliquer sont définies avec le client en fonction de la nature des données, de leur utilisation prévue et de ses exigences de confidentialité.
Lorsque les données identifiantes ne doivent pas quitter l’infrastructure du client, la dé-identification peut être réalisée directement sur ses propres serveurs. Infoscribe peut accompagner la mise en place des outils et du workflow nécessaires, puis intervenir à distance dans cet environnement sécurisé. Seules les données préalablement dé-identifiées peuvent ensuite, si l’architecture du projet le prévoit, être mises à disposition de l’environnement d’annotation.
Cette organisation permet de dé-identifier les données au plus près de leur source, avant leur transfert éventuel et avant leur accès par les équipes d’annotation.
Oui. Infoscribe peut réaliser un projet d’annotation de données médicales directement dans l’environnement technique du client. Nos équipes peuvent utiliser vos plateformes d’annotation existantes, vos outils propriétaires ou un environnement spécifiquement déployé pour le projet.
Lorsque des données de santé sensibles ne peuvent pas quitter vos serveurs, Infoscribe peut vous accompagner dans l’installation et la configuration des outils nécessaires directement sur votre infrastructure. Nos équipes peuvent ensuite accéder à cet environnement à distance, avec des droits limités aux besoins du projet, pour réaliser l’annotation et le contrôle qualité sans transférer le dataset vers les serveurs d’Infoscribe.
Cette architecture peut être utilisée pour des données DICOM, NIfTI, images médicales 2D ou 3D, vidéos chirurgicales ou données cliniques, selon les outils retenus et les contraintes du projet.
Lorsque les données peuvent être externalisées mais doivent rester dans l’Union européenne, Infoscribe peut également mettre à disposition un environnement hébergé sur ses infrastructures en France. Pour les projets nécessitant un hébergement spécifique des données de santé, nous pouvons recourir à un hébergement HDS en France.
L’architecture, les outils d’annotation, les modalités d’accès et le workflow de production et de contrôle sont définis pendant le pilote afin d’adapter l’environnement aux exigences techniques, réglementaires et de sécurité du projet.
La qualité d’un dataset médical dépend à la fois de la précision des annotations, de la clarté des consignes et du niveau d’expertise clinique mobilisé. Infoscribe propose trois niveaux de qualité contractuelle pour l’annotation de données médicales : 95 %, 97 % ou 99 %, définis avec le client en fonction de la complexité et des objectifs du projet.
Chaque projet commence par un pilote d’annotation médicale sur un échantillon représentatif. Cette phase permet d’identifier les cas ambigus, de préciser les règles d’annotation, de mesurer la cadence et de déterminer quels profils doivent intervenir dans la production et le contrôle qualité.
Selon le projet, les annotations peuvent être réalisées ou contrôlées par des annotateurs spécialisés, étudiants en 5e année de médecine, médecins, radiologues, chirurgiens-dentistes ou autres spécialistes. Le niveau d’expertise peut être différent entre l’annotation initiale et sa validation afin d’utiliser l’expertise médicale là où elle apporte réellement de la valeur.
Le processus de contrôle peut associer contrôle des annotations, contrôle indépendant par une seconde équipe, validation médicale, double annotation ou arbitrage des désaccords. Le taux d’échantillonnage et le niveau de contrôle sont adaptés au niveau de qualité contractuel retenu et aux risques identifiés pendant le projet.
Les erreurs et non-conformités détectées sont documentées et analysées afin d’en identifier la cause et d’éviter leur répétition. Si la qualité mesurée est inférieure au niveau contractuel de 95 %, 97 % ou 99 %, les données concernées sont corrigées ou réannotées sans frais supplémentaires, puis soumises à un nouveau contrôle.
Notre objectif est de produire un dataset médical exploitable au niveau de qualité attendu dès la première livraison, plutôt que de faire reposer le contrôle final sur les équipes du client.
Oui. À la demande, Infoscribe peut intégrer au projet d’annotation de données médicales un dispositif de traçabilité destiné à contribuer à la constitution de votre dossier de gouvernance des données pour l’AI Act.
Nous pouvons notamment documenter la provenance des données, les versions des consignes d’annotation, les règles appliquées, les opérations de préparation et de dé-identification, les profils d’annotateurs et d’experts mobilisés, les contrôles qualité réalisés, les taux de conformité mesurés ainsi que les non-conformités, corrections et réannotations effectuées.
Pour un projet d’IA médicale, cette documentation permet notamment de conserver l’historique des opérations réalisées sur les datasets d’entraînement, de validation ou de test et de documenter les processus d’annotation, d’étiquetage, de nettoyage ou d’enrichissement des données.
Ces informations peuvent être consolidées dans un dossier de gouvernance des données remis avec le dataset afin d’alimenter la documentation AI Act du client et de faciliter la traçabilité des opérations réalisées par Infoscribe.
Cette prestation contribue à la préparation de votre documentation réglementaire mais ne constitue pas, à elle seule, une certification de conformité AI Act du dispositif médical ou du système d’intelligence artificielle dans son ensemble.